燃煤锅炉的烟尘、二氧化硫（SO2）和氮氧化物（NOx)等大气污染物的主要排放源。但是，循环流化床锅炉的床温保持在800-900℃之间，而这一温度区间正是脱硫反应效率最高的温度区间。因而，在适当的钙硫比和石灰石粒度下，可获得高达80%--90%的脱硫率。

另外，由于较低的燃烧温度，采用分级送风，使循环流化床锅炉燃烧时产生的氮氧化物也远低于煤粉炉。 因此，循环流化床燃煤锅炉的二氧化硫和氮氧化物排放量都较低。